Characteristics of fungemia in a peruvian referral center: 5-year retrospective analysis. / Características de las fungemias en un centro de referencia del Perú: retrospectiva de cinco años.

Retrospective descriptive study carried out to determine the characteristics of fungemia in 285 cancer patients hospitalized from 2012 to 2016 at the Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas (INEN). Demographic, clinical and microbiological information was evaluated. Fungemia by C. albicans predominated in patients with solid tumors and without neutropenia, while those caused by C. tropicalis predominated in patients with hematological neoplasia and neutropenia. C. tropicalis was the agent isolated in most cases (47.0%). Fungemia increased over time in patients without neutropenia. Fungemia caused by C. albicans increases with age in patients with solid tumors without neutropenia. It is concluded that fungemia are mainly caused by C. tropicalis in patients with hematological neoplasia with neutropenia and by C. albicans in patients with solid tumors without neutropenia. In addition, fungemia in patients without neutropenia increases over time; and those caused by C. albicans increase with age in patients with solid tumors without neutropenia.

Con el objetivo de conocer las características de las fungemias en 285 pacientes oncológicos hospitalizados del 2012 al 2016 en el Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas se realizó un estudio descriptivo retrospectivo. Se evaluó información demográfica, clínica y microbiológica. Las fungemias por C. albicans predominaron en pacientes con tumores sólidos y sin neutropenia, mientras las causadas por C. tropicalis predominaron en pacientes con neoplasias hematológicas y neutropenia. C. tropicalis fue el agente más aislado (47,0%). Las fungemias aumentaron con el tiempo en los pacientes sin neutropenia. Las fungemias causadas por C. albicans aumentan con la edad en pacientes con tumores sólidos sin neutropenia. Se concluye que las fungemias son mayormente causadas por C. tropicalis en pacientes con neoplasias hematológicas con neutropenia y por C. albicans en pacientes con tumores sólidos sin neutropenia. Además, las fungemias en pacientes sin neutropenia aumentan en el tiempo y las causadas por C. albicans, en tumores sólidos sin neutropenia, aumentan con la edad.

Características de las fungemias en un centro de referencia del Perú: retrospectiva de cinco años / Characteristics of fungemia in a peruvian referral center: 5-year retrospective analysis

RESUMEN Con el objetivo de conocer las características de las fungemias en 285 pacientes oncológicos hospitalizados del 2012 al 2016 en el Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas se realizó un estudio descriptivo retrospectivo. Se evaluó información demográfica, clínica y microbiológica. Las fungemias por C. albicans predominaron en pacientes con tumores sólidos y sin neutropenia, mientras las causadas por C. tropicalis predominaron en pacientes con neoplasias hematológicas y neutropenia. C. tropicalis fue el agente más aislado (47,0%). Las fungemias aumentaron con el tiempo en los pacientes sin neutropenia. Las fungemias causadas por C. albicans aumentan con la edad en pacientes con tumores sólidos sin neutropenia. Se concluye que las fungemias son mayormente causadas por C. tropicalis en pacientes con neoplasias hematológicas con neutropenia y por C. albicans en pacientes con tumores sólidos sin neutropenia. Además, las fungemias en pacientes sin neutropenia aumentan en el tiempo y las causadas por C. albicans, en tumores sólidos sin neutropenia, aumentan con la edad.

ABSTRACT Retrospective descriptive study carried out to determine the characteristics of fungemia in 285 cancer patients hospitalized from 2012 to 2016 at the Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas (INEN). Demographic, clinical and microbiological information was evaluated. Fungemia by C. albicans predominated in patients with solid tumors and without neutropenia, while those caused by C. tropicalis predominated in patients with hematological neoplasia and neutropenia. C. tropicalis was the agent isolated in most cases (47.0%). Fungemia increased over time in patients without neutropenia. Fungemia caused by C. albicans increases with age in patients with solid tumors without neutropenia. It is concluded that fungemia are mainly caused by C. tropicalis in patients with hematological neoplasia with neutropenia and by C. albicans in patients with solid tumors without neutropenia. In addition, fungemia in patients without neutropenia increases over time; and those caused by C. albicans increase with age in patients with solid tumors without neutropenia.

[Molecular identification of Aspergillus fumigatus isolated from patients with invasive aspergillosis]. / Identificación molecular de Aspergillus fumigatus aislados de pacientes con aspergilosis invasiva.

The objective of the study was to identify molecularly-isolated strains of Aspergillus from patients with invasive aspergillosis (IA); these strains were primarily typed as Aspergillus fumigatus sensu lato by conventional phenotypic methods. We worked with 20 strains from the mycology section of the Institute of Tropical Medicine "Daniel A. Carrión." To obtain the fungal DNA, thermal shock, enzymatic treatment, and silica gel column techniques were used; and it was stored at -20°C to preserve it. The real-time polymerase chain reaction (qPCR) procedure included fluorochrome-labeled primers, which amplified the specific sequences of A. fumigatus. Fluorescence was measured with the thermocycler at the end of the hybridization phase of each cycle. It was molecularly-identified that only 50% of the strains studied belong to the species Aspergillus fumigatus sensu stricto.

El objetivo del estudio fue identificar molecularmente cepas de aspergillus aislados de pacientes con aspergilosis invasiva (AI), que fueron tipificadas primariamente como Aspergillus fumigatus sensu lato por métodos fenotípicos convencionales. Se trabajó con 20 cepas de la micoteca de la sección de micología del Instituto de Medicina Tropical "Daniel A. Carrión". Para obtener el ADN fúngico se emplearon las técnicas de choque térmico, tratamiento enzimático y columnas de silica-gel; y se almacenó a -20 0C para conservarlo. En el procedimiento de la reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real (qPCR) se incluyeron primers marcados con fluorocromo, los cuales amplificaron las secuencias específicas de A. fumigatus. La fluorescencia se midió con el termociclador al final de la fase de hibridación de cada ciclo. Se identificó molecularmente que sólo el 50% de las cepas estudiadas pertenecen a la especie Aspergillus fumigatus sensu stricto.

Identificación molecular de Aspergillus fumigatus aislados de pacientes con aspergilosis invasiva / Molecular identification of Aspergillus fumigatus isolated from patients with invasive aspergillosis

RESUMEN El objetivo del estudio fue identificar molecularmente cepas de aspergillus aislados de pacientes con aspergilosis invasiva (AI), que fueron tipificadas primariamente como Aspergillus fumigatus sensu lato por métodos fenotípicos convencionales. Se trabajó con 20 cepas de la micoteca de la sección de micología del Instituto de Medicina Tropical "Daniel A. Carrión". Para obtener el ADN fúngico se emplearon las técnicas de choque térmico, tratamiento enzimático y columnas de silica-gel; y se almacenó a -20 0C para conservarlo. En el procedimiento de la reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real (qPCR) se incluyeron primers marcados con fluorocromo, los cuales amplificaron las secuencias específicas de A. fumigatus. La fluorescencia se midió con el termociclador al final de la fase de hibridación de cada ciclo. Se identificó molecularmente que sólo el 50% de las cepas estudiadas pertenecen a la especie Aspergillus fumigatus sensu stricto.

ABSTRACT The objective of the study was to identify molecularly-isolated strains of Aspergillus from patients with invasive aspergillosis (IA); these strains were primarily typed as Aspergillus fumigatus sensu lato by conventional phenotypic methods. We worked with 20 strains from the mycology section of the Institute of Tropical Medicine "Daniel A. Carrión." To obtain the fungal DNA, thermal shock, enzymatic treatment, and silica gel column techniques were used; and it was stored at -20°C to preserve it. The real-time polymerase chain reaction (qPCR) procedure included fluorochrome-labeled primers, which amplified the specific sequences of A. fumigatus. Fluorescence was measured with the thermocycler at the end of the hybridization phase of each cycle. It was molecularly-identified that only 50% of the strains studied belong to the species Aspergillus fumigatus sensu stricto.

Epidemiología de las dermatomicosis en 30 años de estudio en el Instituto de Medicina Tropical Daniel A. Carrión, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Lima, Perú / Epidemiology of dermatomycoses in 30 years of study at Daniel A. Carrion Institute of Tropical Medicine, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Lima, Peru

Objetivos: Determinar la evolución epidemiológica de las dermatomicosis en pacientes de consultorio externo durante el periodo 1976-2005. Diseño: Estudio descriptivo, retrospectivo y analítico. Lugar: Instituto de Medicina Tropical æDaniel Alcides CarriónÆ, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Lima, Perú. Participantes: Pacientes positivos a dermatomicosis. Intervenciones: Se revisó las historias clínicas de 7 185 (55,3 por ciento) casos positivos a dermatomicosis. El instrumento de investigación empleado fue la ficha de levantamiento de información. Principales medidas de resultados: Agente etiológico, estación del año, sexo, edad y forma clínica. Resultados: El estudio demostró que los más afectados fueron del grupo etario de 16 a 30 años (42,7 por ciento) y sexo femenino (52,1 por ciento). La dermatomicosis más frecuente fue la onicomicosis (43,6 por ciento). Los agentes patógenos de mayor prevalencia fueron Trichophyton rubrum (33,2 por ciento), Cándida albicans (15,3 por ciento), Cándida no albicans (11,8 por ciento), Trichophyton mentagrophytes (9,4 por ciento), Malassezia spp (9,1 por ciento) y las infecciones mixtas (7,2 por ciento). Las micosis de cuero cabelludo muestran continuo aumento durante todo el estudio. El dermatofito Epidermophyton floccosum fue aislado por última vez en la década del 90. A partir de 1995 ha aumentado la prevalencia de Cándida no albicans y se encontró como especie re-emergente a la levadura Cándida tropicalis. Conclusiones: Entre los años 1976 y 2005 hubo importantes variaciones epidemiológicas en relación a las formas clínicas y a la etiología de las dermatomicosis...

Objectives: To determine dermatomycoses epidemiological evolution in outpatients during the period 1976-2005. Design: Descriptive, retrospective, and analytical study. Setting: Daniel Alcides Carrion Institute of Tropical Medicine, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Lima, Peru. Participants: Patients positive to dermatomycoses. Interventions: Medical records of 7 185 (55.3 per cent) dermatomycoses-positive patients were reviewed. Main outcome measures: Etiologic agent, season, gender, age, and clinical forms. Results: Females (52.1 per cent) and the 16 to 30 year-old group (42.7 per cent) were the most affected. Most frequent dermatomycoses was onychomycosis (43.6 per cent). Most prevalent pathogens were Trichophyton rubrum (33.2 per cent), Candida albicans (15.3 per cent), Candida non albicans (11.8 per cent), Trichophyton mentagrophytes (9.4 per cent), Malassezia spp. (9.1 per cent), and mixed infections (7.2 per cent). The fungal scalp infection showed steady increase during the period studied. Epidermophyton floccosum dermatophyte was isolated for the last time in the 1990s. Since 1995 prevalence of Candida non albicans has increased and Candida tropicalis yeast species are re-emerging. Conclusions: Epidemiological changes in dermatomycoses clinical forms and etiology were found between 1976 and 2005...

Identificación de especies de Malassezia aisladas de piel sana en pobladores de Lima, Perú / Identification of Malassezia species isolated from healthy skin in residents of Lima, Peru

Objetivo: Identificar las especies de Malassezia en zonas seborreicas de piel sana en población limeña. Diseño: Estudio descriptivo transversal. Lugar: Instituto de Medicina Tropical æDaniel Alcides CarriónÆ, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Lima, Perú. Participantes: Pobladores asintomáticos. Intervenciones: Empleando la técnica de Mariat y Adan-Campos, se recolectó muestras de piel de 129 pobladores asintomáticos de diversos distritos de la ciudad de Lima. El aislamiento de Malassezia se realizó en medio Dixon modificado e incubado a 32 grados centígrados por 7 días, la identificación de las colonias por sus características macro y micromorfológicas, y la tipificación mediante el estudio de las propiedades bioquímicas y fisiológicas según la técnica de Guillot y col. Principales medidas de resultados: Especie de Malassezia, sexo, edad y región anatómica. Resultados: Se aisló Malassezia spp en 43,4 por ciento de los pobladores, obteniéndose 49,2 por ciento en varones y 37,5 por ciento en mujeres. De las diferentes regiones corporales, 68 cultivos fueron positivos: cuero cabelludo 31 (45,6 por ciento), espalda 36 (52,9 por ciento) y región frontal 1 (1,5 por ciento). El grupo etario con mayor frecuencia de aislamientos (47,2 por ciento) fue el de 14 a 25 años (adolescentes jóvenes). M. slooffiae fue encontrado en 83,8 por ciento y M. obtusa en 16,2 por ciento de los casos. Conclusiones: Se encontró Malassezia spp. en la piel humana sana. M. slooffiae fue la especie predominante de los casos positivos (83,8 por ciento) seguido de M. obtusa (16,2 por ciento)...

Objective: To identify Malassezia species in healthy skin seborrhea areas in Lima inhabitants. Design: Cross-sectional study. Setting: Daniel Alcides Carrion Tropical Medicine Institute, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Lima, Peru. Participants: Asymptomatic persons. Interventions: Skin samples were collected from 129 asymptomatic residents of several districts of Lima city using Mariat and Adan-CamposÆ technique. Malassezia isolation was performed in modified Dixon medium and incubated at 32 grades centigrades for 7 days. Colonies were identified by macro and micro morphological characteristics and typing was determined by biochemical and physiological properties using GuillotÆs technique. Main outcome measures: Malassezia species, participantsÆ gender, age and anatomical region. Results: Malassezia spp was isolated in 43.4 per cent of the residents, 49.2 per cent in men and 37.5 per cent in women. From various body regions 68 cultures were positive: scalp 31 (45.6 per cent), back 36 (52.9 per cent) and frontal region 1 (1.5 per cent). Isolates most common age group (47.2 per cent) was that of adolescents-young (14-25 year-old). M. slooffiae was found in 83.8 per cent and M. obtusa in 16.2 per cent of cases. Conclusions: Malassezia spp. was present in healthy human skin. M. slooffiae was the predominant species in positive cases (83.8 per cent) followed by M. obtusa (16.2 per cent)...